Lo que el problema de Duhem nos indica es que la aplicación del modus tollens dentro del proceso científico no está libre de dudas o de decisiones no justificadas por las reglas de la lógica. En muchos casos no se puede pensar en un procedimiento mecánico que permita ir de forma directa de los enunciados singulares al rechazo de las teorías; hay que pensar en otro tipo de prácticas que la simple y mecánica aplicación de un algoritmo libre de cualquier influencia subjetiva.
